12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_R0056 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_R0056  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869004  normal  0.328325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t25  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 71 bp  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0087  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 74 bp  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0256242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0091  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 74 bp  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA61  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1569  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1604  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6019  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00348951  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0053  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0035  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.987391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0066  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000867267  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0018  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>