56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_R0017 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_R0017  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0002  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00924229  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0094  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022711  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000904393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0040  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0631602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0105  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.904682  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09060  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0250104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0034  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0050  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.850399  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0036  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0622774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0018  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0054  tRNA-Gly  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0271354  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0008  tRNA-Gly  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0112  tRNA-Gly  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2525  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000865266  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0037  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2515  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0285567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0034  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371143  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0032  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000809268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0035  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2314  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2229  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2219  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000214695  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2628  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3265  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0032  tRNA-His  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11980  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000114191  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0006  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3264  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3262  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.733644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3268  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0036  tRNA-His  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0128871  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0016  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.034253  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0020  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0669163 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07190  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.886703 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0028  tRNA-His  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11950  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000172827  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0004  tRNA-His  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.60167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0033  tRNA-His  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.704433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0037  tRNA-His  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0609753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14029  tRNA-His  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0033  tRNA-His  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>