10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0036 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_R0036  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0622774  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0009  tRNA-Asn  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.940514  normal  0.189803 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0012  tRNA-Asn  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.571236  normal  0.0197692 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0007  tRNA-Asn  96.77 
 
 		 106 bp  54  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0035  tRNA-Asn  96.77 
 
 		 106 bp  54  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0017  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0053  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.914408  normal  0.310755 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32340  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.301649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0032  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.201714 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1570  tRNA-Val  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.736418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>