25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32340 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32340  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.301649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0042  tRNA-Gln  90.48 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0053  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.355739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0011  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42458  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14016  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0439144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0020  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0046  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0041  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0041  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.646474  normal  0.266593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0044  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0920336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0024  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0020  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13370  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0908228  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0003  tRNA-Gln  85.25 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30190  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.548182  normal  0.107034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0051  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0014  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677743  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0041  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696806 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0053  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102013  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0061  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152555  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09030  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0036  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0622774  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0068  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0022  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0023  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.692118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>