17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_R0003 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_R0003  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0019  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000894602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0009  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0045  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0018  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0012  tRNA-Gln  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0990174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32340  tRNA-Gln  85.25 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.301649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0074  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0056  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0021  tRNA-Gln  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585103  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0022  tRNA-Gln  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113221  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0020  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0017  tRNA-Gln  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.869148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30190  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.548182  normal  0.107034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0053  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102013  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0047  tRNA-Gln  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.953041  normal  0.766725 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0024  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>