12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_R0009 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_R0009  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0019  tRNA-Gln  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000894602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0056  tRNA-Gln  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00620013  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0021  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.275054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0003  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_713  tRNA-Gln  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0721369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0005  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.229862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0020  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0012  tRNA-Gln  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0990174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1395  tRNA-Gln  86.27 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0061  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>