11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_R0056 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_R0056  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0009  tRNA-Gln  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0019  tRNA-Gln  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000894602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0005  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.229862  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00620013  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0021  tRNA-Gln  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.275054  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_713  tRNA-Gln  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0721369  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05440  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0003  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0061  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0020  tRNA-Gln  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>