17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_R0020 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_R0020  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0051  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0041  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.646474  normal  0.266593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0041  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0044  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0920336  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0046  tRNA-Gln  89.36 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0020  tRNA-Gln  89.36 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14016  tRNA-Gln  89.36 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0439144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13370  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0908228  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32340  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.301649 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0009  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0012  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.686329  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0053  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0003  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0052  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000973809  hitchhiker  0.00167748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0019  tRNA-Gln  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000894602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0056  tRNA-Gln  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>