21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_R0041 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_R0044  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0920336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0041  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.646474  normal  0.266593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0041  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0046  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0020  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14016  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0439144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0042  tRNA-Gln  91.8 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32340  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.301649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0006  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0024  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13370  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0908228  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0068  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09030  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0022  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0061  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152555  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0041  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0023  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.692118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0014  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0020  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0051  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0060  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0418927  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>