18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_R0061 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_R0061  tRNA-Gln  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243759  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0029  tRNA-Gln  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000392756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0044  tRNA-Gln  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0044  tRNA-Gln  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0948234  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0040  tRNA-Gln  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0024  tRNA-Gln  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0413047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0027  tRNA-Gln  87.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0065  tRNA-Gln  85.29 
 
 
74 bp  56  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000202254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0065  tRNA-Gln  85.29 
 
 
74 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.398704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0031  tRNA-Gln  85.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0338385  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0049  tRNA-Gln  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192349  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0012  tRNA-Gln  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0269689  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0001  tRNA-Gln  83.82 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0045  tRNA-Gln  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000500622  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0040  tRNA-Gln  83.1 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000862753 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0045  tRNA-Gln  82.43 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0542906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0009  tRNA-Gln  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0056  tRNA-Gln  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>