9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1395 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1395  tRNA-Gln  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0015  tRNA-Gln  95.71 
 
 		 71 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165404  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0004  tRNA-Gln  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.628498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26560  tRNA-Gln  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000051562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA49  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0009  tRNA-Gln  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0042  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0054  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0012  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0990174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>