15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_R0012 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_R0012  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0990174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0034  tRNA-Gln  97.06 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.144366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt03  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0019  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000894602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0003  tRNA-Gln  89.13 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26560  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000051562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0040  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0202702  normal  0.855024 
 
 
-
 
NC_002950  PGt28  tRNA-Gln  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0009  tRNA-Gln  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0015  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165404  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0013  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0017  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1395  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0015  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0049  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.866993  normal  0.692724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>