14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PGt28 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PGt28  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt03  tRNA-Gln  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0023    89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.875544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0024  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0524275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0054  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875791  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0059  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.431552 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0022  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0042  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA49  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0045  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0542906  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.54 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0012  tRNA-Gln  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0990174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0013  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0038  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>