16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_R0045 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_R0045  tRNA-Gln  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0542906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0031  tRNA-Gln  93.62 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0338385  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0024  tRNA-Gln  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0413047  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0065  tRNA-Gln  88.46 
 
 
74 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.398704  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0005  tRNA-Gln  88.24 
 
 
71 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.229862  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt28  tRNA-Gln  87.04 
 
 
74 bp  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PGt03  tRNA-Gln  85.19 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0014  tRNA-Gln  88.1 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0023  tRNA-Gln  88.1 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.692118 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0044  tRNA-Gln  82.43 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0948234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0061  tRNA-Gln  82.43 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243759  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0022  tRNA-Gln  88.1 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0068  tRNA-Gln  88.1 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0061  tRNA-Gln  88.1 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152555  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0041  tRNA-Gln  88.1 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000696806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0006  tRNA-Gln  88.1 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>