37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0065 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0065  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.398704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0065  tRNA-Gln  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000202254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0040  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233905  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0014  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0044  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0948234  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0022  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0023  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.692118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0068  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0061  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152555  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0041  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0006  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0027  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0031  tRNA-Gln  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0338385  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0005  tRNA-Gln  91.84 
 
 		 71 bp  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.229862  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09030  tRNA-Gln  91.07 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0049  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200257  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0023    87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.875544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0024  tRNA-Gln  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0524275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0021  tRNA-Gln  94.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585103  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0054  tRNA-Gln  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875791  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0022  tRNA-Gln  94.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113221  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0059  tRNA-Gln  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.431552 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0022  tRNA-Gln  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0049  tRNA-Gln  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0302524  normal  0.0464215 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0045  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0542906  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0061  tRNA-Gln  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243759  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10730  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0676617  normal  0.337131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0042  tRNA-Gln  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0041  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0015  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0029  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000392756  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0013  tRNA-Gln  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0024  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0413047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0047  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0018  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0040  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000862753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0045  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.422548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>