12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_R0027 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_R0027  tRNA-Gln  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0065  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.398704  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0044  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0948234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0061  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243759  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0031  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0338385  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0065  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000202254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0005  tRNA-Gln  86.79 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.229862  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0040  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000862753 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10730  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0676617  normal  0.337131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0024  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0413047  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0040  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233905  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0029  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000392756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>