27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0029 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0029  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000392756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0061  tRNA-Gln  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0044  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0044  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0948234  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0001  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0005  tRNA-Gln  91.07 
 
 		 71 bp  71.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.229862  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0024  tRNA-Gln  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0413047  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0071  tRNA-Gln  96.88 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0071  tRNA-Gln  96.88 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0070  tRNA-Gln  96.88 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.519832  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0010  tRNA-Gln  96.88 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.347599  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0067  tRNA-Gln  96.88 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.922568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0041  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0040  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233905  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0007  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0002  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131125  normal  0.199971 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1560  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0007  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0032  tRNA-Gln  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0024  tRNA-Gln  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271857  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0040  tRNA-Gln  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000862753 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0027  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0065  tRNA-Gln  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000202254  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0031  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0004  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0919548 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0065  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.398704  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0039  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>