41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0041 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0041  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2742  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000362566  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0045  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515378  hitchhiker  0.000000000930227 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0003  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0038  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0020  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0005  tRNA-Gln  91.84 
 
 		 71 bp  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.229862  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0001  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0017  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0807433  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0040  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000862753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0032  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0024  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271857  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0017  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0052  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0033  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.305698  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4593  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0422846  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0029  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000392756  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0007  tRNA-Gln  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0031  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0010  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0012  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0269689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0045  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000500622  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0049  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0049  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.866993  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0065  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.398704  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0017  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0017  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.854869  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0004  tRNA-Gln  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0919548 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0009  tRNA-Gln  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0031  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0338385  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0070  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.519832  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0071  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0002  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131125  normal  0.199971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0071  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0067  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.922568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0032  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1560  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0039  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1115  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0010  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.347599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>