55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_R0012 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_R0012  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0269689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0045  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000500622  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0049  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0036  tRNA-Gln  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0103538  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0050  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0052  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2742  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000362566  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0045  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515378  hitchhiker  0.000000000930227 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0057  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0004  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0919548 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0002  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131125  normal  0.199971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0014  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0032  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0039  tRNA-Gln  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216834  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0032  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0003  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0054  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0023  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0010  tRNA-Gln  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.347599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0032  tRNA-Gln  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0024  tRNA-Gln  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6019500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0068  tRNA-Gln  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.118963  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0031  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4593  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0422846  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0667259  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0007  tRNA-Gln  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0071  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0070  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.519832  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0067  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.922568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0041  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_896  tRNA-Gln  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000031288  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0034  tRNA-Gln  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253342  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0044  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0064  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00065623  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0029  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1115  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0007  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1560  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0061  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243759  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0007  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0053  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0046  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0040  tRNA-Gln  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0033  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.305698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0020  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0017  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0807433  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0006  tRNA-Gln  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0007  tRNA-Gln  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0017  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0038  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0066  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0043  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000274188  normal  0.032981 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0010  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0039  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>