37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_R0007 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_R0007  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0007  tRNA-Gln  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4593  tRNA-Gln  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0422846  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1115  tRNA-Gln  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0031  tRNA-Gln  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0004  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0919548 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0053  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1560  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t30  tRNA-Gln  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.357296  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0007  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0007  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0032  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0071  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0020  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0042  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0070  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.519832  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0038  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0067  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.922568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0010  tRNA-Gln  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.347599  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0071  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA49  tRNA-Gln  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0012  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0039  tRNA-Gln  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216834  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0045  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515378  hitchhiker  0.000000000930227 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2742  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000362566  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0001  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0054  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1358  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0053  tRNA-Gln  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0046  tRNA-Gln  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0012  tRNA-Gln  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0269689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0010  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505008  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0045  tRNA-Gln  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000500622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0045  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0049  tRNA-Gln  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0018  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>