30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_R0012 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_R0012  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0010  tRNA-Gln  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505008  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0043  tRNA-Gln  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0028  tRNA-Gln  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0390985  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0034  tRNA-Gln  93.48 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.144366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0018  tRNA-Gln  91.84 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0045  tRNA-Gln  91.84 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0017  tRNA-Gln  87.1 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.869148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0039  tRNA-Gln  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0047  tRNA-Gln  89.8 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.953041  normal  0.766725 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0023  tRNA-Gln  89.8 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.692118 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0041  tRNA-Gln  89.8 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0047  tRNA-Gln  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0014  tRNA-Gln  89.8 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0061  tRNA-Gln  89.8 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152555  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0022  tRNA-Gln  89.8 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0068  tRNA-Gln  89.8 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0007  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0006  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09030  tRNA-Gln  87.76 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0021  tRNA-Gln  87.76 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585103  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0032  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0022  tRNA-Gln  87.76 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113221  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0003  tRNA-Gln  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0049  tRNA-Gln  85 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200257  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0057  tRNA-Gln  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0007  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10730  tRNA-Gln  83.87 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0676617  normal  0.337131 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4593  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0422846  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0015  tRNA-Gln  83.87 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>