10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_R0028 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_R0028  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0390985  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0010  tRNA-Gln  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505008  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0012  tRNA-Gln  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0043  tRNA-Gln  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0034  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.144366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0039  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189682  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0017  tRNA-Gln  87.1 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.869148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0047  tRNA-Gln  89.8 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.953041  normal  0.766725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0045  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0018  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>