45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_R0018 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_R0045  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0018  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0047  tRNA-Gln  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.953041  normal  0.766725 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0017  tRNA-Gln  95.83 
 
 		 75 bp  119  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.869148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0047  tRNA-Gln  95.83 
 
 		 75 bp  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0021  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585103  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0022  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113221  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09030  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0015  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 75 bp  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0014  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0068  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0022  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0061  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152555  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0023  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.692118 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0041  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0006  tRNA-Gln  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0053  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18610  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0924107  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10730  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0676617  normal  0.337131 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08660  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0012  tRNA-Gln  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0013  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428815  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0015  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0051  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.321747  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0048  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0047  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0066  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0012  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0016  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0012  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14036  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000697589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0010  tRNA-Gln  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505008  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0020  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265513  normal  0.355823 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0047  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000306339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0049  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0039  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216834  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0049  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.462929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0003  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0028  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0390985  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0043  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0057  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11070  tRNA-Gln  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0065  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.398704  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0007  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0034  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.144366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>