27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_R0054 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_R0054  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA49  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0042  tRNA-Gln  95.83 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0024  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0524275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0054  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875791  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0059  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.431552 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0022  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0023    93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.875544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4593  tRNA-Gln  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0422846  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1560  tRNA-Gln  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t30  tRNA-Gln  94.59 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.357296  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0007  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0010  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.347599  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0004  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.628498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0031  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0020  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0071  tRNA-Gln  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0067  tRNA-Gln  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.922568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0007  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0070  tRNA-Gln  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.519832  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0038  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0053  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0007  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1115  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0007  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1395  tRNA-Gln  100 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0038  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>