9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_R0004 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_R0004  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.628498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0038  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0054  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1395  tRNA-Gln  93.94 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA49  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0042  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0053  tRNA-Gln  83.33 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t30  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.357296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1560  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>