33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR_t30 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR_t30  tRNA-Gln  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.357296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1560  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0038  tRNA-Gln  95.77 
 
 		 74 bp  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0020  tRNA-Gln  95.77 
 
 		 74 bp  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0031  tRNA-Gln  95.77 
 
 		 74 bp  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0053  tRNA-Gln  95.77 
 
 		 74 bp  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1115  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0071  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0070  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.519832  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0067  tRNA-Gln  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.922568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0004  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0919548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0007  tRNA-Gln  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0007  tRNA-Gln  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0071  tRNA-Gln  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0010  tRNA-Gln  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.347599  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0032  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0007  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4593  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0422846  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0007  tRNA-Gln  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA49  tRNA-Gln  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0042  tRNA-Gln  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0054  tRNA-Gln  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0046  tRNA-Gln  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0053  tRNA-Gln  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2742  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000362566  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0002  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131125  normal  0.199971 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0045  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515378  hitchhiker  0.000000000930227 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0039  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0039  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216834  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0032  tRNA-Gln  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0050  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0004  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.628498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>