30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_R0053 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_R0053  tRNA-Gln  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0046  tRNA-Gln  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0004  tRNA-Gln  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0919548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0031  tRNA-Gln  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183795  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  89.83 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0032  tRNA-Gln  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170303  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1115  tRNA-Gln  93.02 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1560  tRNA-Gln  87.93 
 
 
76 bp  60  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0038  tRNA-Gln  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132474  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4593  tRNA-Gln  90 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0422846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0020  tRNA-Gln  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0050  tRNA-Gln  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0032  tRNA-Gln  90.91 
 
 
74 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t30  tRNA-Gln  90.7 
 
 
71 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.357296  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0007  tRNA-Gln  88 
 
 
74 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0045  tRNA-Gln  84.75 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515378  hitchhiker  0.000000000930227 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_896  tRNA-Gln  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000031288  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0667259  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2742  tRNA-Gln  84.75 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000362566  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0007  tRNA-Gln  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0053  tRNA-Gln  88.37 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0034  tRNA-Gln  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253342  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0071  tRNA-Gln  82.43 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0049  tRNA-Gln  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192349  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0070  tRNA-Gln  82.43 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.519832  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0045  tRNA-Gln  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000500622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0007  tRNA-Gln  86.96 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0067  tRNA-Gln  82.43 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.922568  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0007  tRNA-Gln  86.96 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0012  tRNA-Gln  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0269689  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>