226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_R0039 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_R0039  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216834  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0068  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.118963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0024  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6019500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0032  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2518  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0017354  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2529  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2621  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0485041  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2222  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000059382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2233  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2307  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000654744  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0012  tRNA-Gln  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0269689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0049  tRNA-Gln  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0045  tRNA-Gln  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000500622  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0032  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0004  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0919548 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00008  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000112561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00009  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000116069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0066  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.69731e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0718  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136719  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0065  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000612595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0792  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00549034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0826  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000524699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0026  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.151797  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0779  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000652384  normal  0.543785 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0581  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000459899  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0079  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0791  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0431042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0758  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000782067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0686  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000180239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0067  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0028  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.242939  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0687  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000017545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0080  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0066  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0358271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4648  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000366514  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0733  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000545743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0719  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000164709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0827  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000850909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0780  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000640046  normal  0.628389 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5014  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4649  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000820589  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0030  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000433047  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0074  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0732  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000561331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0074  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0757  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000702107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4593  tRNA-Gln  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0422846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0007  tRNA-Gln  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0041  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0041  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.794543  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0050  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0045  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0031  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1115  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0018  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1560  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0114  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.1228e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0106  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0049  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  88.14 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0064  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00065623  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0580  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000400154  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0029  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08660  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0095  tRNA-Gln  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0028  tRNA-Gln  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t30  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.357296  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0007  tRNA-Gln  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18610  tRNA-Gln  93.94 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0924107  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0053  tRNA-Gln  93.94 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0036  tRNA-Gln  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0103538  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0010  tRNA-Gln  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.347599  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0015  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0017  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.869148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0016  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0048  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10730  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0676617  normal  0.337131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0054  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5689  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t016  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t017  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t020  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000616644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000069751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000190168  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0007  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln01  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln02  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00912183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0034  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495722  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0035  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000486361  normal  0.144926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0038  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374137  normal  0.148016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0035  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000023217  normal  0.116994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0036  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000579663  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0039  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000688787  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0007  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0032  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0053  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>