52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_R0048 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_R0048  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08660  tRNA-Gln  97.26 
 
 		 75 bp  129  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18610  tRNA-Gln  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0924107  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0053  tRNA-Gln  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0016  tRNA-Gln  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0051  tRNA-Gln  94.52 
 
 		 75 bp  113  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.321747  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14036  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000697589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11070  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0012  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0012  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0013  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428815  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0047  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000306339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0049  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.462929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0037  tRNA-Gln  93.44 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.461495  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1358  tRNA-Gln  89.04 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0066  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0015  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0047  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220381  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0017  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0017  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.869148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0047  tRNA-Gln  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0020  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265513  normal  0.355823 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0036  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.868665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09030  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0047  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.953041  normal  0.766725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0061  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152555  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0041  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0045  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0068  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0014  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0023  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.692118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0022  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0018  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0015  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10730  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0676617  normal  0.337131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0006  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0022  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113221  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0021  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585103  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0053  tRNA-Gln  89.8 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203875  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0040  tRNA-Gln  94.59 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0039  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216834  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0041  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0029  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0040  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0017  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000220842  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0064  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00065623  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0029  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>