17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_R0054 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_R0054  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0006  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0040  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0012  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0269689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0049  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0045  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000500622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0036  tRNA-Gln  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0103538  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0032  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0032  tRNA-Gln  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0068  tRNA-Gln  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.118963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0024  tRNA-Gln  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6019500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0052  tRNA-Gln  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0039  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216834  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0003  tRNA-Gln  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0032  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0004  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0919548 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>