87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_R0052 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_R0052  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0012  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0269689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0045  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000500622  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2742  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000362566  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0045  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515378  hitchhiker  0.000000000930227 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0032  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0049  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0036  tRNA-Gln  90 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0103538  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0003  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0020  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0038  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0018  tRNA-Gln  86.57 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.751418  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0002  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131125  normal  0.199971 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0041  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0050  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0004  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0919548 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0667259  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_896  tRNA-Gln  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000031288  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0057  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0034  tRNA-Gln  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253342  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0054  tRNA-Gln  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0010  tRNA-Gln  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.347599  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1560  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0068  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.118963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0032  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0024  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6019500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0014  tRNA-Gln  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0071  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0015  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000666826  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5689  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231453  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0193  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000238459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0296  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000266549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0611  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000107562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0855  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000488484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0049  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5655  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000792898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5669  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5717  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00280638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5727  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0780  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.63949e-30 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5682  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4576  tRNA-Gln  88 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0809637 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4766  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0106  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0040  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5047  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5652  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000646012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5143  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000037642  normal  0.817541 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0172  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0373789 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5661  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0274  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0536  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34797e-32 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  88 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000190168  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0039  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  88 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  88 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000160535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000106014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000964949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  88 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000184976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0083  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000812357  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  88 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000069751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  88 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000616644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  88 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  88 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  88 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.75916e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  88 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0951866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  88 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000198835  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0070  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.519832  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0107  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000302226  hitchhiker  0.0000021052 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0038  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000497098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0047  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000522107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0085  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000545364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0095  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000269172  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4783  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0161693  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0067  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.922568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0038  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0048  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000232523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0089  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0099  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  88 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0054  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000219013  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0054  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000756603  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna4  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>