44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0032 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0032  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0052  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0053  tRNA-Gln  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0038  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0020  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0018  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.751418  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0050  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0045  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000500622  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0049  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0667259  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_896  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000031288  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0012  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0269689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0034  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253342  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2742  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000362566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0036  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0103538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0045  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515378  hitchhiker  0.000000000930227 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0003  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0057  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0054  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0046  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0053  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0017  tRNA-Gln  85.07 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0017  tRNA-Gln  85.07 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.854869  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0032  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0014  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1560  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0019  tRNA-Gln  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0009  tRNA-Gln  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0046  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0017  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0024  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6019500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t30  tRNA-Gln  85 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.357296  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0017  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0807433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0068  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.118963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0010  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0032  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171845  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0033  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.305698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0039  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216834  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0071  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0004  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0919548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0070  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.519832  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0067  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.922568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0041  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>