25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_R0036 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_R0036  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0103538  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0049  tRNA-Gln  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0012  tRNA-Gln  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0269689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0045  tRNA-Gln  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000500622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0050  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0052  tRNA-Gln  90 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0057  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0003  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2742  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000362566  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0045  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515378  hitchhiker  0.000000000930227 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0032  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0032  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0054  tRNA-Gln  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0068  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.118963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0032  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0024  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6019500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0023  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0039  tRNA-Gln  84.06 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189682  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0039  tRNA-Gln  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216834  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0040  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000435375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0037  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000166881  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0036  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0004  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0919548 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0014  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>