14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_R0018 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_R0018  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.751418  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0053  tRNA-Gln  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0017  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.854869  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0017  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0009  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0032  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0052  tRNA-Gln  86.57 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0003  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0001  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0004  tRNA-Gln  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0004  tRNA-Gln  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0001  tRNA-Gln  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0001  tRNA-Gln  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.570603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0001  tRNA-Gln  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.939464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>