73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_R0050 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_R0050  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0012  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0269689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0045  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000500622  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0014  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0049  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2742  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000362566  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0045  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515378  hitchhiker  0.000000000930227 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0057  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0032  tRNA-Gln  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0036  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0103538  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0023  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0032  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0031  tRNA-Gln  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0053  tRNA-Gln  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0046  tRNA-Gln  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0052  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0004  tRNA-Gln  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0919548 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0667259  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0034  tRNA-Gln  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253342  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_896  tRNA-Gln  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000031288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0039  tRNA-Gln  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0010  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0017  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0017  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0807433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0033  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.305698  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1115  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t016  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0053  tRNA-Gln  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1560  tRNA-Gln  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t020  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0034  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257252  normal  0.0258068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0037  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000116845  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0032  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333525  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0033  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210301  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t017  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0029  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0028  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000428392  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0034  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495722  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0035  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000486361  normal  0.144926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0038  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374137  normal  0.148016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0039  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000688787  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0035  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000023217  normal  0.116994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0036  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000579663  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0013  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln01  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln02  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00912183  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0103  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0102  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0099  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895438  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0098  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000673061  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0097  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000737452  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0094  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300776  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0023    96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.875544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0024  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6019500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0054  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875791  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0024  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0524275 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0059  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.431552 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0022  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0068  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.118963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0050  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000114197  normal  0.509569 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0044  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0948234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0032  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171845  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t30  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.357296  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0090  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.925974  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0071  tRNA-Gln  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0070  tRNA-Gln  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.519832  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0020  tRNA-Gln  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0038  tRNA-Gln  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0067  tRNA-Gln  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.922568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0104  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000537672  normal  0.102798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0103  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000561751  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0101  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000260011  normal  0.104999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>