15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_R0032 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_R0024  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271857  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0032  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0568383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0040  tRNA-Gln  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000862753 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0041  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0038  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0020  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0071  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0012  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0067  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.922568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0070  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.519832  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0071  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0029  tRNA-Gln  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000392756  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0001  tRNA-Gln  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0023  tRNA-His  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0023  tRNA-His  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000017569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>