13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_R0049 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_R0049  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0302524  normal  0.0464215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0023    89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.875544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0024  tRNA-Gln  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0524275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0054  tRNA-Gln  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875791  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0059  tRNA-Gln  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.431552 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0022  tRNA-Gln  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0042  tRNA-Gln  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0040  tRNA-Gln  85.51 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0065  tRNA-Gln  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000202254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0065  tRNA-Gln  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.398704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA49  tRNA-Gln  88 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0069  tRNA-Gln  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0024  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0413047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>