22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_R0017 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_R0017  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0031  tRNA-Gln  94.83 
 
 		 71 bp  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0032  tRNA-Gln  94.83 
 
 		 71 bp  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0048  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08660  tRNA-Gln  89.04 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0053  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18610  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0924107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0049  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.462929  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0047  tRNA-Gln  92.86 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000306339 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0013  tRNA-Gln  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11070  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0020  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265513  normal  0.355823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0024  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0524275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0022  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0059  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.431552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0054  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875791  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0023    96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.875544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0016  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0025  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0713301  normal  0.06286 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0012  tRNA-Gln  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0990174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0051  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.321747  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0047  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>