9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30190 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30190  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.548182  normal  0.107034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0053  tRNA-Gln  95.83 
 
 		 75 bp  119  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0060  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0418927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26560  tRNA-Gln  92.98 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000051562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0053  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.355739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0011  tRNA-Gln  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42458  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32340  tRNA-Gln  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.301649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0003  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0012  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.686329  normal  0.594816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>