125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Gly-1 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0701067  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0034  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.849322  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0406  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00766095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0074  tRNA-Gly  91.94 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0059  tRNA-Gly  91.94 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0044  tRNA-Gly  91.94 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265162  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  90.32 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  90.32 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna36  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0073  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0023  tRNA-Gly  88.71 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000259024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0039  tRNA-Gly  88.71 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372449  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0032  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 71 bp  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.629344  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0009  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 71 bp  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.365276  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0008  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297445  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0048  tRNA-Gly  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0048  tRNA-Gly  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  97.06 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0062  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0049  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000210611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0059  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000205536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0057  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0056  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.661302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0067  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.38974  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14027  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0004  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0072  tRNA-Gly  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0211705  normal  0.918041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0078  tRNA-Gly  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0011  tRNA-Gly  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  2.9187400000000002e-24  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0006  tRNA-Gly  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.328073  hitchhiker  0.00695117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0034  tRNA-Gly  86.89 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1215  tRNA-Gly  96.97 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0018  tRNA-Gly  86.89 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00399522  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0062  tRNA-Gly  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0121694  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t22  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4566  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.778703  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0017  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0043  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.782815 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0561  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000476059  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1214  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0017  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0035  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0044  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000110049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0018  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.395535  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0053  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000779558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0021  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0025  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0957376  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0039  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0034  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.530843  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0031  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.754836  normal  0.341264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0035  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.072829  normal  0.169297 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0057  tRNA-Gly  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0031  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0030  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0043  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11940  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0041  tRNA-Gly  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0308  tRNA-Gly  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05586  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000136136  normal  0.200305 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00107854  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0057  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00632698  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3796  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000000939303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0021  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0019  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3086  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0078  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0058  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0060  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000611366  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0013  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000164045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0012  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000183499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3188  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469441  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0052  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1904  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000012603  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3764  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3826  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.216257  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3459  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000712395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0010  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137284  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0018  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0013  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179187  normal  0.143307 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0013  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000407891  normal  0.589115 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0047  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0071  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000687699  normal  0.228297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0058  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136383  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0049  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.323662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0041  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0026  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.768519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA37  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0021  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.292095 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>