47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_R0020 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_R0020  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0047  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0005  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0046  tRNA-Gly  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2053  tRNA-OTHER  87.04 
 
 		 68 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000041496  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00076  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000423625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0107  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000460652  hitchhiker  0.00217641 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1180  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000995593  hitchhiker  0.000000000000787361 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4426  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  hitchhiker  0.0000476038 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0698  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00121364  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4695  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.29308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4476  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000038079  hitchhiker  0.00000000000000785716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4473  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0000778472  hitchhiker  0.000364054 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4354  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000304012  normal  0.98071 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4386  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000113588  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4550  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000345033  hitchhiker  0.00000000000121992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5443  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000114766  hitchhiker  0.00132893 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0082  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000798848  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0089  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00198921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0007  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000140906  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0007  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000568475  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna050  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna007  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2801  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000458752  normal  0.102156 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0092  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000154336  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0001  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.3029e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly01  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0005  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000491266  normal  0.390681 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0490  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.826084  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2721  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000223193  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4287  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.14711e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00235  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06159  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4719  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.20782e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5102  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000061566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0013  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000181775  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0007  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000313428  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0027  tRNA-Gly  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0356  tRNA-Gly  86.54 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.192081  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02828  tRNA-Gly  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06802  tRNA-Gly  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3206t  tRNA-OTHER  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0593259  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1112t  tRNA-Gly  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1121t  tRNA-OTHER  85.19 
 
 		 69 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5030  tRNA-Gly  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.539673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5034  tRNA-Gly  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.616369  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0076  tRNA-Gly  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000390983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>