83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_AR0035 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_AR0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243975  normal  0.0115468 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0014  tRNA-Leu  91.38 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t39  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0009  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.763492  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1876  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0037  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.948936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0016  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.718102  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0022  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.35191  normal  0.518198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0037  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0037  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.53557  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02662  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0048  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0047  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0006  tRNA-Leu  83.54 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.806028  normal  0.553629 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0046  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531396  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0046  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1288  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60280  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0027  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.654797  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14570  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0020  tRNA-Leu  88.46 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0038  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0023  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  83.82 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t29  tRNA-Leu  88 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000148867  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872486  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0019  tRNA-Leu  88 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.800017  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0032  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0032  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0032  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00166696  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0033  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0009  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0046  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t075  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000081141 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_BR0027  tRNA-OTHER  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.821905  normal  0.138884 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0121967  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0118  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0899953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0063  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0026  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4326  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92812  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>