34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_R0026 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0036  tRNA-Leu  90.62 
 
 
88 bp  79.8  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0876  tRNA-Leu  90.7 
 
 
86 bp  54  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.322681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.011451  normal  0.263113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0036  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.798802  normal  0.436937 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0036  tRNA-Leu  96.3 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.773561  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0018  tRNA-Leu  96.3 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.864301 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0559105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.131977 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.97423e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>