100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_R0028 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2160  tRNA-Leu  97.37 
 
 
87 bp  67.9  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000000935406  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0006  tRNA-Leu  97.14 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.806028  normal  0.553629 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0643  tRNA-Leu  97.14 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.149876  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.201383  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1032  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.56958  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1729  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.716299  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0823  tRNA-Leu  94.59 
 
 
84 bp  58  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0029  tRNA-Leu  94.59 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000562682  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0023  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0027  tRNA-Leu  84.51 
 
 
85 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000640555  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0042  tRNA-Leu  84.81 
 
 
84 bp  54  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.30317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2245  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000124407  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0070  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  96.67 
 
 
84 bp  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0029  tRNA-Leu  96.67 
 
 
84 bp  52  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0582952  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0022  tRNA-Leu  96.67 
 
 
87 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  96.55 
 
 
89 bp  50.1  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0050  tRNA-Leu  85.25 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.822506 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0038  tRNA-Leu  96.55 
 
 
86 bp  50.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0037  tRNA-Leu  91.89 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000169907 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0028  tRNA-Leu  91.89 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385004  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0054  tRNA-Leu  91.89 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0764192  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.331877  hitchhiker  0.00233917 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0042  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535149 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0059  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0075209  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361468  hitchhiker  0.00416301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0052  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0535721 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  96.43 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0099  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5112  tRNA-Leu  83.1 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00828021  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4742  tRNA-Leu  83.1 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0097  tRNA-Leu  83.1 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.138568  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4752  tRNA-Leu  83.1 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5788  tRNA-Leu  83.1 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0370957  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4872  tRNA-Leu  83.1 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0248766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4772  tRNA-Leu  83.1 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.193191  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4955  tRNA-Leu  83.1 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.2776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4835  tRNA-Leu  83.1 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.80579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4891  tRNA-Leu  83.1 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.762047  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2501  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00083  tRNA-Leu  83.1 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0082  tRNA-Leu  83.1 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0014  tRNA-Leu  83.1 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.3 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0572  tRNA-Leu  96.3 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0082  tRNA-Leu  83.1 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.514859  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1974  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3345  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0074  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3331  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0502824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2346  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2388  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.519883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1247  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0075  tRNA-Leu  83.1 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0015  tRNA-Leu  83.1 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4726  tRNA-Leu  83.1 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0202862  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.629999  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0023  tRNA-Leu  93.33 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.618598  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0049  tRNA-Leu  89.47 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20505  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t021  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0063  tRNA-Leu  93.33 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000700338  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0060  tRNA-Leu  93.33 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000996161  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0020  tRNA-Leu  93.33 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00905739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  hitchhiker  0.00010396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000655039  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0023  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0072  tRNA-Leu  93.33 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.021945  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0089  tRNA-Leu  93.33 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189785  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  96.15 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00110731  hitchhiker  0.0000326076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.114161  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73025  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0034  tRNA-Leu  91.18 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.670287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0063  tRNA-Leu  91.18 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.381313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0086  tRNA-Leu  93.33 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0089  tRNA-Leu  93.33 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0093  tRNA-Leu  93.33 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023989  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0023  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0052  tRNA-Leu  93.33 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0462143  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0054  tRNA-Leu  93.33 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0462143  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0058  tRNA-Leu  93.33 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29408  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>