More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4010 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4010  ABC transporter related  100 
 
 
257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  43.95 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  44.35 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  43.95 
 
 
258 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  43.95 
 
 
258 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  43.95 
 
 
258 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  44.05 
 
 
257 aa  211  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.15 
 
 
258 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  43.65 
 
 
257 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  45.75 
 
 
593 aa  208  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  42.75 
 
 
258 aa  208  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  44.13 
 
 
256 aa  208  8e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  43.95 
 
 
258 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  43.55 
 
 
258 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  43.95 
 
 
258 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.55 
 
 
257 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  43.55 
 
 
258 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  43.55 
 
 
255 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  44.94 
 
 
593 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  44.13 
 
 
264 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  42.74 
 
 
258 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  43.55 
 
 
255 aa  205  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  42.91 
 
 
255 aa  204  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  44.94 
 
 
257 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  43.32 
 
 
260 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  43.32 
 
 
260 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  44.35 
 
 
257 aa  202  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  42.19 
 
 
260 aa  202  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.55 
 
 
258 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  44.35 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  43.15 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  44.53 
 
 
610 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.95 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  43.15 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  43.15 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  43.15 
 
 
257 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  41.94 
 
 
253 aa  195  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  42.34 
 
 
259 aa  195  6e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  41.13 
 
 
255 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  40.08 
 
 
250 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  42.4 
 
 
256 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  41.3 
 
 
257 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  42.58 
 
 
616 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  39.92 
 
 
255 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  41.04 
 
 
255 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  43.31 
 
 
268 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  44.96 
 
 
663 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  40.16 
 
 
271 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  39.68 
 
 
250 aa  191  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  47.64 
 
 
823 aa  191  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  43.32 
 
 
264 aa  191  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  41.7 
 
 
257 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  47.98 
 
 
827 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  41.13 
 
 
257 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  47.24 
 
 
823 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3819  ABC transporter related  39.68 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0171499  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  39.27 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  41.7 
 
 
252 aa  189  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
256 aa  189  5e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  40.73 
 
 
257 aa  189  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  39.68 
 
 
258 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  41.43 
 
 
258 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  38.71 
 
 
254 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  42.91 
 
 
599 aa  188  7e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
271 aa  188  7e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  42.19 
 
 
274 aa  188  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  42.11 
 
 
261 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  37.25 
 
 
251 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6414  ABC transporter related  42.35 
 
 
258 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476451  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  39.92 
 
 
270 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 
254 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  41.25 
 
 
276 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
255 aa  186  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 
254 aa  186  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0478  ABC transporter related  41.9 
 
 
634 aa  186  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
256 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  40.16 
 
 
257 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  40.78 
 
 
259 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  39.92 
 
 
259 aa  185  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  39.92 
 
 
252 aa  184  9e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  42.34 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  39.11 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4124  ABC transporter related  42.56 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  41.7 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  36.84 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2181  ABC branched-chain amino acid transporter, fused ATPase and inner-membrane subunits  45.1 
 
 
652 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1768  ABC transporter related  45.49 
 
 
652 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.412398  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1697  ABC transporter-related protein  45.1 
 
 
652 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  40.89 
 
 
283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  39.68 
 
 
251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1406  ABC transporter related  42.51 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  37.65 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  40.71 
 
 
261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>