More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1519 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1519  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 355 aa  689    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0248055  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  36.68 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  36.61 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 356 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 343 aa  159  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  30.42 
 
 		 341 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  33.56 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  29.1 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  31.77 
 
 		 340 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  30.66 
 
 		 339 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 364 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  29.76 
 
 		 330 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  29.73 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  27.76 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3046  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 356 aa  109  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  29.65 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3765  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 357 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 366 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 366 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2609  HTH-type transcriptional regulator VqsM  30.31 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  33.57 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0469  helix-turn-helix domain-containing protein  29.73 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  30.41 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  37.65 
 
 		 327 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0747  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0400  transcriptional regulator, AraC family  29.18 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5976  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  34.69 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0593  putative transcriptional regulator  31.6 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  26.78 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4360  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30620  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0924433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  30.82 
 
 		 390 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3372  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 389 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 389 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2159  helix-turn-helix domain-containing protein  25.77 
 
 		 340 aa  97.8  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.802618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  29.19 
 
 		 352 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 364 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 425 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 347 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 343 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 344 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  32.07 
 
 		 350 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 365 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  27.76 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 346 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3834  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 338 aa  94  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  27.86 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  26.28 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 355 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  31.34 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1560  AraC family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0191  AraC family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.211144  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0996  AraC family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1365  AraC family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.884424  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0219  AraC family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2578  AraC family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>