55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0936 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  72.63 
 
 
650 aa  957    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  100 
 
 
647 aa  1301    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  88.87 
 
 
644 aa  1175    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  31.8 
 
 
615 aa  278  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  34.43 
 
 
623 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  31.44 
 
 
628 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  31.44 
 
 
628 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  31.44 
 
 
628 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  32.83 
 
 
622 aa  248  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  30.65 
 
 
594 aa  230  8e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  34.5 
 
 
591 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  30.26 
 
 
601 aa  216  9e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  30.99 
 
 
671 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  24.41 
 
 
564 aa  81.3  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  23.6 
 
 
728 aa  80.5  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.61 
 
 
830 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  26.45 
 
 
461 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  26.33 
 
 
749 aa  78.2  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  30.09 
 
 
787 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1968  KAP P-loop domain protein  22.15 
 
 
1137 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  26.82 
 
 
736 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  26.21 
 
 
467 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  25.24 
 
 
770 aa  72  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  23.42 
 
 
513 aa  63.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2201  KAP P-loop  23.93 
 
 
1128 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  23.91 
 
 
463 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  23.91 
 
 
463 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  26.35 
 
 
758 aa  60.8  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  25.47 
 
 
464 aa  58.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  24.51 
 
 
394 aa  58.2  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  24.88 
 
 
489 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  28.24 
 
 
611 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  21.71 
 
 
715 aa  55.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  20.65 
 
 
862 aa  55.1  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  33.33 
 
 
1065 aa  55.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4058  KAP P-loop domain-containing protein  24.56 
 
 
506 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  24.71 
 
 
471 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  21.98 
 
 
565 aa  52.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  31.71 
 
 
488 aa  51.2  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  22.97 
 
 
315 aa  51.2  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  27.35 
 
 
580 aa  51.2  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  23.68 
 
 
444 aa  50.8  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  24.84 
 
 
571 aa  50.4  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  29.33 
 
 
459 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  23.31 
 
 
542 aa  49.7  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0709  hypothetical protein  24.48 
 
 
1064 aa  48.9  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2072  KAP P-loop  21.61 
 
 
997 aa  48.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.285295 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  28.57 
 
 
509 aa  47.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  26.1 
 
 
579 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  19.43 
 
 
1093 aa  47.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  22.31 
 
 
706 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3848  KAP P-loop domain-containing protein  28.85 
 
 
925 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000964208 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  20.87 
 
 
884 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  41.67 
 
 
510 aa  44.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  23.77 
 
 
784 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>