57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4815 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0661  ATPase  60.23 
 
 		 615 aa  715    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 		 623 aa  1259    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  39.94 
 
 		 622 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  38.45 
 
 		 628 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  38.45 
 
 		 628 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  38.45 
 
 		 628 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  38.06 
 
 		 594 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  41.1 
 
 		 591 aa  363  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  37.54 
 
 		 601 aa  344  2.9999999999999997e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  34.17 
 
 		 650 aa  263  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  34.43 
 
 		 647 aa  263  8.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  34.43 
 
 		 644 aa  263  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  27.37 
 
 		 671 aa  171  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  28.94 
 
 		 564 aa  94  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  24.46 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  24.79 
 
 		 787 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  25.5 
 
 		 513 aa  69.7  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  23.79 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  24.29 
 
 		 749 aa  67.4  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  24.54 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  23.99 
 
 		 715 aa  64.7  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  22.02 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  23.51 
 
 		 884 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  24.37 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  20.14 
 
 		 736 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.41 
 
 		 830 aa  61.2  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  22.85 
 
 		 728 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  23.43 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  23.43 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4058  KAP P-loop domain-containing protein  23.63 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1065 aa  58.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  24.56 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  31.17 
 
 		 459 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  24.01 
 
 		 467 aa  56.2  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3848  KAP P-loop domain-containing protein  21.28 
 
 		 925 aa  56.2  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000964208 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  21.79 
 
 		 735 aa  54.7  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  22.62 
 
 		 758 aa  54.7  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  22.02 
 
 		 706 aa  54.7  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  21.85 
 
 		 784 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  25.51 
 
 		 770 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  20.74 
 
 		 488 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  19.61 
 
 		 862 aa  53.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  35.9 
 
 		 1093 aa  51.2  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  24.27 
 
 		 580 aa  50.8  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2476  KAP P-loop domain-containing protein  29.47 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  hitchhiker  0.00802204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1968  KAP P-loop domain protein  20.34 
 
 		 1137 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  22.22 
 
 		 444 aa  48.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  24.51 
 
 		 579 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  19.46 
 
 		 315 aa  46.2  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  20.82 
 
 		 945 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2201  KAP P-loop  32.97 
 
 		 1128 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  26.12 
 
 		 542 aa  44.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  25.97 
 
 		 509 aa  44.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  22.98 
 
 		 611 aa  44.3  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0158  KAP P-loop domain-containing protein  23.18 
 
 		 445 aa  43.9  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0561  hypothetical protein  23.4 
 
 		 577 aa  43.9  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  36.96 
 
 		 565 aa  43.9  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>