37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4058 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_4058  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 		 506 aa  1041    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  41.96 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  41.48 
 
 		 542 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  39.9 
 
 		 580 aa  291  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  39.95 
 
 		 571 aa  272  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  37.69 
 
 		 565 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  33.71 
 
 		 509 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  31.14 
 
 		 394 aa  170  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  33.51 
 
 		 489 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  31.37 
 
 		 459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  32.45 
 
 		 510 aa  160  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  31.44 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  31.18 
 
 		 488 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  29.09 
 
 		 467 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0158  KAP P-loop domain-containing protein  32.23 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  29.73 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  29.46 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  27.46 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2476  KAP P-loop domain-containing protein  27.38 
 
 		 443 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  hitchhiker  0.00802204 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  29.28 
 
 		 444 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  25.65 
 
 		 564 aa  68.2  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  24.67 
 
 		 594 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_002978  WD1179  hypothetical protein  21.76 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  23.63 
 
 		 623 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  26.97 
 
 		 615 aa  56.6  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  20.28 
 
 		 671 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  25.24 
 
 		 601 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  22.74 
 
 		 644 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  24.56 
 
 		 647 aa  54.7  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  26.87 
 
 		 591 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  20.97 
 
 		 513 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  33.85 
 
 		 628 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  33.85 
 
 		 628 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  33.85 
 
 		 628 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  23.51 
 
 		 650 aa  47  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  23.77 
 
 		 622 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  22.27 
 
 		 735 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>