37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0333 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 
571 aa  1179    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  49.49 
 
 
579 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  49.83 
 
 
580 aa  537  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  47.84 
 
 
565 aa  529  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  58.06 
 
 
542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4058  KAP P-loop domain-containing protein  40.82 
 
 
506 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  36.3 
 
 
509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  31.31 
 
 
394 aa  154  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  32.19 
 
 
489 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  28.86 
 
 
459 aa  152  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  29.1 
 
 
510 aa  151  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  30.82 
 
 
488 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  30.1 
 
 
471 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  29.96 
 
 
463 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  29.96 
 
 
463 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  30.56 
 
 
467 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0158  KAP P-loop domain-containing protein  30.77 
 
 
445 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  31.68 
 
 
464 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2476  KAP P-loop domain-containing protein  28.33 
 
 
443 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  hitchhiker  0.00802204 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  31.91 
 
 
444 aa  95.1  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  22.3 
 
 
564 aa  75.1  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_002978  WD1179  hypothetical protein  24 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  24.09 
 
 
591 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  24.84 
 
 
647 aa  50.4  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  42 
 
 
601 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  24.01 
 
 
644 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  24.18 
 
 
650 aa  47.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  21.84 
 
 
706 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  21.74 
 
 
784 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  33.78 
 
 
513 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  22.71 
 
 
594 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.59 
 
 
830 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  23.1 
 
 
461 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  22.98 
 
 
622 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  36.17 
 
 
628 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  36.17 
 
 
628 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  36.17 
 
 
628 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>